Вы не написали, какая у вас Windows? Если Windows XP, например, то загружаете ту, которую нужно оставить. Открываете файл boot.ini, который находится в корневом каталоге диска С:/, удаляете ненужные строчки загрузки ненужных вам версий Windows. Перезагружаетесь. Проверяете работу программ. Если все прошло удачно, то, например, с помощью проводника удаляете ненужные папки Windows. Все.
Если не понятно, пишите.